暗部分两类。一类，火影直属暗部，二类，完全受团**立管理的‘根’。
职能：火影直属暗部对外。根暗部对内。
‘根’里，同样也分两大类。
第一种：由各大家族的精英选拔进入。
代表人物：山中一族：山中风。油女一族：油女取根（原定油女志乃。后因取根能力特殊。破格换人。）
洗脑程度：中级。
第二种：由一些战争孤儿组成。幼年培养，接受血雾之村类似的残酷修炼。特点，杀死自己的队友。
代表人物：佐井，大和（后被三代带走）
洗脑程度：顶级。
根职责：监督木叶忍者，追杀木叶判忍。监视宇智波一族。（类似于jijiai）执行普通忍者或暗部不好处理的事：屠村（团藏为了挑起土之国的战争，让暗部屠了边城的几个村庄。）灭族。
火影直属暗部与根职责不同，在必要时，根暗部和火影暗部一起执行任务。部分职责共用。
代表人物：卡卡西，鼬。大和
卡卡西和鼬都曾经在团藏的部下做事。
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