1777年，葡萄牙的玛丽亚一世女王继位，名义上她和丈夫佩德罗三世共治，实际上佩德罗从来不理朝政，只是关心打猎和宗教事务。
当时正值美国独立期间，在这场战争中西班牙法国英国及荷兰都卷入了，而葡萄牙与巴西的贸易正处于活跃期，于是在1776年蓬巴尔侯爵建议国王签署了一项法令，禁止所有的葡萄牙港口对北美的船只开放，并将这些船只视为海盗，理由是因为这样恶例会引诱一些封臣反叛他们的自然领主。
继位后的玛丽亚一世女王继续执行蓬巴尔的这一政策，使得葡萄牙处于中立，而当时由于战争，美国切断了与英国大西洋贸易，这有利于葡萄牙这样的中立国作为英国商品的供应国销售。在此期间葡萄牙的红酒出口量也大量增加，英国货进口量却少了，这段时间葡萄牙与英国的贸易第一次出现顺差。
从1757年到1777年，约有25000名奴隶从葡属几内亚运往帕拉和马拉尼昂，为了帮助巴西和葡萄牙定居者，葡萄牙政府还为他们提供贷款，并将利息从5下降到3，最后完全取消，奴隶出售的价格是按照他们在非洲西海岸出售的价格再加上一点点运输费制定的。这段时间巴西的可可豆在数量上成倍增长，还有棉花稻米兽皮。
自里斯本大地震后，包括国王在内都住在木结构的住宅里，后来这木屋还被烧毁了，多亏了这段时间贸易的增加，王室才能在木建筑的原址上重新修巴洛克洛可可风格的宫殿，然而工程进行到一半，又因为财政紧张和国内运动打断了工程。
不过伤害最大的还是由吕西安和戈多伊率领的橘子战争，工程不得不中途停止。自法国爆发大革命之后葡萄牙的警察总监马涅克就一直企图阻止有关大革命的报纸和书籍在葡萄牙流传，葡萄牙的外交官认为必须与西班牙英国联手对付法国。
那时葡萄牙女王玛丽亚一世的身体和精神状态就不怎么好了，1782年蓬巴尔侯爵去事，蓬巴尔的政敌就开始叫嚣着要对蓬巴尔一派的人动手，玛丽亚一世对此进行了镇压。
曾经有一些波尔图市民，在喝醉了之后上街闹事，反对上杜罗河农业和葡萄酒总公司，因为该公司垄断了波尔图所有的酒店，还关闭了许多小酒馆。这些人后来都被镇压了，13名男人和1名女人在绞死后示众，10名妇女和46名男人被流放，另外还有大批人被送到大帆船上去服苦役。
由于蓬巴尔的政策诞生了一些新贵族，玛丽亚一世镇压的却是旧贵族。这些得益于蓬巴尔侯爵的垄断公司的另一个特权是可以对葡萄牙殖民地的一些特定的产品征税，由此保证了王室可以在特定的时间里获得固定的税收。
总之玛丽亚一世对镇压旧贵族保有极度的不安与愧疚，又加上她的丈夫1786年去世，因为悲痛她的精神更不稳定，再加上欧洲动荡不安的局势让她心力交瘁，于是1792年她的忧郁症变为疯癫，有时甚至清醒有时糊涂，无人敢设想她能继续执政，她的长子若奥已经成为实际的统治者。
路易十六被押送上了断头台，这一年法国派了一名使节来葡萄牙，试图劝说葡萄牙保持中立，但是他一到边境就被驱逐了，紧接着葡萄牙与英国西班牙的谈判完成，若奥王子与西班牙和英国订立了新的同盟条约。
可是战争并不顺利，1795年西班牙背着葡萄牙和英国，与法国签订了和平条约，这样法国就转而对付英国与葡萄牙之间的联盟。戈多伊要求与若奥王子结盟，而若奥王子认为葡萄牙失去了很多军备，需要英国这个盟友，并没有答应不允许英国的船只不能再葡萄牙的港口停泊的要求。
接着西班牙向英国宣战，葡萄牙派人去巴黎展开谈判，试图保持中立，而法国提出的要求是割让巴西的部分土地，以及赔款换取和平，1797年情人节那天，葡萄牙的一名间谍帮着英国海军在圣文森特角外击溃了法国舰队，4月份法国就驱逐了葡萄牙使节，并强迫西班牙入侵葡萄牙。
那时的国际形势对葡萄牙非常不利，出路只有两条，要么纳入法国，要么与英国结盟，不论哪一条都会破坏葡萄牙的独立。
1801年拿破仑让马德里发出最后通牒，要求葡萄牙在英国和法国之间作出最后的选择，但是葡萄牙保持沉默，4月份法军进攻葡萄牙，一直认为解决葡萄牙问题唯一的办法是出兵占领葡萄牙的戈多伊率领五个纵队支援，然后葡萄牙与西班牙签订了《巴达霍斯条约》，与法国签订了《马德里条约》割让巴西北部的领土给法国，支付2500万法郎赔款，又割让了奥利维萨城给西班牙，却并没有对英国舰队关闭所有的港口。
当西班牙堵着密西西比河，不让英国船只随意出入的时候，在加勒比海及南美游弋的英国舰队也想以牙还牙。不过战时对中立国船只的捕捞是以运送敌货为借口，现在和平了，这个借口不好使，但有人想出了一个办法，那就是解放奴隶。
也有可能最早这么干的是一个废奴主义者，不论如何有二十艘从美国满载着烟草回欧洲的西班牙运奴船被这么捕捞了，接着在利物浦装船的奴隶变少，但葡萄牙并没有取代英国往北美洲贩运奴隶。
葡萄牙依旧想要保持中立，生怕轻举妄动又引来西班牙入侵，葡萄牙国内还有很多亲法派，他们认同法国大革命的价值观。由于担心这些人会在法军和西班牙人的逼近时作出和巴黎类似的举动，当王室撤退时，玛丽亚女王迷迷糊糊的，还在问为什么要离开。
如果不是因为恶劣的天气，他们可能已经被英国军舰护送到巴西了。法国人也没有占领里斯本，然后他们陆续回去了。其实早在1580年就有人提出过将首都从里斯本迁到巴西的事，当时西班牙的统治者是哈布斯堡家族，并且查理五世的私生子击溃了奥斯曼帝国的舰队，获得地中海的霸权，使得西班牙国力达到顶峰。
与此同时荷兰独立了，本来很有雄心壮志，打算在北非开疆扩土的塞巴斯蒂昂1578年战死，他甚至没有留下继承人，如果说有贵族认可为他们交赎金的腓力二世，有人则认可塞巴斯蒂昂的叔祖恩里克一世。这位摄政王别的没什么问题，只是他原本是主教，所以没有子嗣，当他还俗继承王位后本想娶妻，不过当时的教皇格雷高丽十三世与哈布斯堡家族关系良好，并不肯解除恩里克的誓言准许他结婚，过了两年恩里科就死了，哈布斯堡取得了葡萄牙王位。
虽然葡萄牙国王男性血缘已经断绝，但是还有女性继承人，葡萄牙是承认女性继承权的。葡萄牙王女卡塔里娜公爵夫人曾经在1580年宣称有葡萄牙王位合法继承权，却没有成功，因为葡萄牙承认女性继承王位合法，却没有一个女王。
紧接着腓力二世曾经试图在巴西设置副王之职，还有基督骑士团大团长每年可以派往印度一艘私人船只执照以及将他们的一个女儿许配给腓力二世的继承人等条件贿赂卡塔里娜的丈夫，布拉干萨公爵，以使其妻子放弃宣称权。
有人劝卡塔里娜接受副王的头衔在巴西发展，葡萄牙土地贫瘠而且还靠着西班牙，发展处处受限，但卡塔里娜没有同意，她终其一生都在为她的后代夺取葡萄牙王位铺平道路。
如果我们重新夺回埃及，就意味着我们又要和奥斯曼交恶，那么我们在黎凡特的贸易怎么办？一个马赛的商人问乔治安娜。
他的问题引起了交头接耳。
而且我们已经派出代办，在地中海东部各国重建领事馆了，更何况在英国人撤走前我不认为我们有可能重新夺回埃及。
咳咳。阿斯顿马丁咳嗽了一声，打算附和的人都闭上了嘴。
乔治安娜没有出声，她能说什么呢？就是因为防着法国人重新夺回埃及，并以此为跳板进军印度，英国人才在马尔他不走，而提起马尔他就是波拿巴的逆鳞。
法尔荣倒是坚定得看着她，不过他老了，而且只有一个人，他的支持又有多大的力量呢。
阿尔及尔怎么样？
一直保持沉默的巴里荣问道。
所有人看着他。
阿尔及尔能种棉花吗？巴里荣问。
恐怕要考察后才知道。佩里埃说。
那就组织一只探险队吧。巴里荣对乔治安娜说让您的那位朋友，别去刚果，去阿尔及尔怎么样？